Krajowy System e-Faktur, podobnie jak struktury JPK KR PD i JPK KR ST dla podatników prowadzących księgi rachunkowe, zaczyna funkcjonować już w 2026 roku. Podobna sytuacja dotyczy podatników PIT, którzy będą składać struktury JPK KPiR (rozliczający się na zasadach ogólnych i podatku liniowym), JPK EWP (rozliczający się na ryczałcie) oraz JPK ŚT.
Przedsiębiorcy po wysyłce faktur do KSeF będą je stamtąd importować do programów, w których prowadzą księgi rachunkowe czy KPiR i wykazywać numery faktur z KSeF w swoich plikach JPK KR PD i JPK KPiR wysyłanych do urzędu skarbowego. Będzie więc bezpośredni związek księgowanych faktur z ich wprowadzeniem do KSeF. Szczególnie istotne będzie wpisanie numerów KSeF faktur w zakładce Dziennik w JPK KR PD oraz w ewidencji środków trwałych w pliku JPK ŚT przy likwidacji środka trwałego czy WNiP. W przypadku JPK KPiR numer KSeF będzie widoczny w kolumnie 3- oznaczenie dowodu księgowego.
Wszystkie te pliki będą stanowić tzw. naczynia połączone, z których organy podatkowe będą czerpać dane i dostaną pełny obraz sytuacji podatkowej i finansowej przedsiębiorcy. Dotychczas dane dotyczące podatku dochodowego były wysyłane w tak szczegółowej formie tylko przy kontroli podatkowej, jedynie VAT był już weryfikowany przez organy na podstawie przesyłanych ewidencji faktur zakupu i sprzedaży. Teraz bez wezwania każdy podatnik będzie musiał sam wysyłać pliki do urzędu skarbowego jako obowiązek sprawozdawczy. Celem jest uszczelnienie systemu podatkowego i pełna automatyzacja.
W węźle Dziennik w pliku JPK KR PD w kolumnie D7 mowa jest o dacie sporządzenia dowodu księgowego, o której mowa w art. 23 ust. 2 pkt 2 ustawy o rachunkowości, umieszczona na dowodzie księgowym przez jego wystawcę, zgodnie z wymogiem określonym w art. 21 ust. 1 pkt 4 ustawy. Jeśli dowód został sporządzony pod datą dokonania operacji gospodarczej i brak jest na dowodzie daty sporządzenia dowodu księgowego, to zgodnie z art. 21 ust. 1 pkt 4, w polu należy umieścić datę operacji gospodarczej (pole daty np. „2016-01-02”). W przypadku faktur będzie to data wystawienia, która nie zawsze będzie zgodna z datą przesłania faktury do KSeF (tryb online i offline24). Dlatego przy imporcie faktur z KSeF należy zwrócić szczególną uwagę na datę, którą zaciąga system księgowy. Sam numer faktury nadany przez KSeF jest widoczny w kolumnie D12 w zakładce Dziennik.
Rozksięgowanie faktury z KSeF będzie widoczne w części Dziennika, jaką jest Konto Zapis. Na tej podstawie organ podatkowy może ocenić czy faktura zakupowa z KSeF została zakwalifikowana jako koszt podatkowy, czy został odliczony w całości podatek VAT, itp. Podobnie z fakturami sprzedażowymi z KSeF – łatwo będzie inspektorom skarbowym ocenić, czy faktura została ujęta w księgach rachunkowych i podatkowych w odpowiednim momencie i czy nie wymaga specjalnego oznaczenia podatkowego (znacznik PD) oraz czy została zastosowana właściwa stawka podatku VAT.
Warto już teraz z początkiem roku wygenerować pliki robocze JPK KR PD czy JPK KPiR i sprawdzić czy faktury zakupowe z KSeF, jak również sprzedażowe są widoczne w plikach z nadanym numerem KSeF oraz jak są rozksięgowane poprzez system księgowy, czy może potrzebne jest dodatkowe konto np. pozabilansowe do pokazania różnic podatkowych przychodowych bądź kosztowych.
dr Małgorzata Rzeszutek
doradca podatkowy

